三代试管技术在预防遗传疾病方面虽然具有显著优势，但仍无法做到百分百筛查所有疾病。这是因为三代试管技术主要限于一些常见的遗传疾病，针对一些罕见的异常疾病，通常是无法被检测到的，同时受试管技术限制，即使是高精度的遗传学检测技术，也无法完全避免误检和漏检的情况。
3代试管为何不能百分百筛查疾病
第三代的试管婴儿是可以帮助不孕不育夫妇怀孕的一项辅助生殖技术，而且能够在胚胎移植前筛查出一些遗传的疾病。对于存在多指问题的患者而言通过这个技术，通常可以在受孕前筛查出携带并指畸形遗传基因的胚胎，以便选择健康胚胎进行植入。但由于受到以下几个因素的影响，所以只能降低遗传风险，不能完全避免。
1、存在误诊率
目前三代的检测技术诊断率为96%，有4%误诊率。该技术不能完全避免新生儿缺陷，就是不能完全区分正常胚胎和基因不正常胚胎。同时技术检测的准确性受到多种因素的影响，包括检测技术的局限性、样本质量、实验操作等，这可能导致检测结果的误差。
2、后天因素较多
虽然3代试管可以筛查多数遗传疾病，但由于人类基因组是非常复杂的，如果母体孕期接触有害物质或感染等，而这也是导致在胚胎在发育过程中分化异常，导致疾病出现，从而不能完全避免疾病。
3、技术限制
目前三代试管技术能够筛查的遗传性疾病有限，主要限于已知的特定基因变异和染色体异常。尤其是对于某些复杂的遗传病，其发病机理涉及多个基因和环境因素的相互作用，目前的检测技术难以全面覆盖。
