患者做三代试管婴儿时，将囊胚进行检测后移植，虽然可以提高优生优育的几率，但由于该技术存在一定的技术限制和操作损伤，且还有遗传疾病的局限性，所以即使采用试管三代进行囊胚检测后移植，也可能会出现移植失败和胎停的风险，同时也并不能百分百避免遗传疾病，对此建议做三代试管的患者，要做好面对潜在风险的准备。
三代试管囊胚检测后仍有风险的原因
对于高龄、遗传病史、染色体异常、习惯性流产的家庭而言，生育是一件很困难的事情，很容易生下畸形儿，但随着三代试管婴儿技术的衍生，从而最大程度上保证了生下健康儿。不过即使通过这个技术在移植前对胚胎进行了一个有效筛选，但也仍存在一定的风险，其原因如下：
1、技术限制
三代试管技术主要针对常见的基因或染色体疾病进行筛查，但目前的技术水平尚不能将所有的基因或染色体疾病全部筛查出来。对于一些细微的遗传基因在试管筛查的时候可能会无法成功筛查掉，而这意味着即使经过三代试管的筛选，囊胚仍可能存在未被检测到的基因或染色体缺陷。
2、存在误差率
三代试管囊胚检测技术的诊断率为96%，存在4%的误诊率，由于并非能百分百筛查，所以不能完全区分正常胚胎和嵌合体胚胎（基因不正常胚胎），所以怀孕后必须做多种产检检查，以保证胎儿的健康。
3、基因多变性
人类基因复杂且多样化，即使是通过筛查的胚胎，也可能存在非染色体异常导致胎停流产的风险，而且移植囊胚后的妊娠阶段，还容易受到烟酒刺激、有毒有害物质刺激、射线、病毒感染等的干扰，所以也容易出现畸形情况。
